เหตุการณ์ในตอนนี้เริ่มขึ้นที่คดีฆาตกรรมต่อเนื่องที่จ้องเล่นงานเฉพาะนักดนตรี และเหยื่อเคราะห์ร้ายในคดีนี้ก็ล้วนแต่เคยเรียนในสถาบันดนตรีของอดีตนักเปียโนชื่อดังคนหนึ่งทั้งนั้น ระหว่างนั้นพวกโคนันได้รับเชิญไปในงานคอนเสิร์ตเปิดมิวสิคฮอลล์ ซึ่งสร้างขึ้นโดยนักเปียโนคนนั้น จุดเด่นของงานคอนเสิร์ตครั้งนี้ก็คือ “ไปป์ออร์แกน” ที่มีประวัติอันยาวนาน, ไวโอลิน”สตราดิวาเรียส” ที่มีชื่อเสียงระดับโลก และเสียงของนักร้องโอเปร่าผู้มีพรสวรรค์ แต่เบื้องหลังงานคอนเสิร์ตนี้ดูมีเรื่องเคลือบแคลงน่าสงสัยหลายอย่าง เมื่อถึงวันงานจู่ๆก็เกิดเหตุระเบิดขึ้นอย่างไม่คาดฝัน มุมหนึ่งของมิวสิกฮอลล์กลายเป็นทะเลเพลิงไปในพริบตา นักร้องนำอากิบะ เรย์โกะถูกปองร้าย และนำไปสู่อันตรายที่เกิดขึ้นกับโคนัน
สำหรับมูฟวี่ภาคนี้ ทำให้ผู้ชมได้ทราบว่าโคนันมีความสามารถพิเศษคือ “เพอร์เฟ็คต์พิชท์(Perfect Pitch)” ซึ่งเป็นพรสวรรค์แต่กำเนิดอย่างหนึ่ง(และสามารถฝึกฝนให้มีได้) เป็นความสามารถที่ทำให้บ่งบอกเสียงที่ได้ยินในพริบตาแรกได้ว่าเป็นคอร์ดหรือโน้ตคีย์อะไร ซึ่งพรสวรรค์นี้อากิบะ เรย์โกะก็มีเช่นกัน