เรื่องราวการผจญภัยของ คูโบ้ (พากย์เสียงโดย อาร์ท พาร์คินสัน) เด็กชายผู้ซึ่งมีความเฉลียวฉลาดและจิตใจงดงาม เขาใช้ชีวิตเรียบง่ายในเมืองริมทะเล ต่อมาชีวิตอันเงียบสงบของเขาก็หายไป เมื่อถูกวิญญาณอาฆาตตามรังควาน คูโบ้ ออกผจญภัยสุดระทึกร่วมกับ ลิง (พากย์เสียงโดย ชาร์ลิซ เธอรอน) และ ด้วง (พากย์เสียงโดย แมทธิว แม็คคอนาเฮย์) เพื่อปกป้องครอบครัวของเขา เขาออกค้นหาดาบ, เสื้อเกราะ และหมวกนักรบ เพื่อที่จะไขปริศนาของพ่อ ซามูไรนักรบผู้ยิ่งใหญ่ที่พลีชีพในสนามรบ คูโบ้ ต้องต่อสู้กับเหล่าทวยเทพและอสุรกาย รวมถึง มูนคิง (พากย์เสียงโดย เรล์ฟ ไฟนส์) ผู้เต็มไปด้วยความอาฆาต และ คู่แฝดปีศาจ (พากย์เสียงโดย รูนีย์ มาร่า) เพื่อไขความลับแห่งตำนาน และทำให้ครอบครัวมารวมกันอีกครั้ง